外表风光无限的堂上综合医院，实际上正经历着经营等方面的困境。在这里，本应“救死扶伤”的医生们似乎忘记了自己的职责与医德，醉心名利，惮于担当，明哲保身，如是弊端重重，正将这家医院推向万劫不复的深渊。这一天，名叫相良浩介（泽村一树 饰）来到此地。他是曾在大学医院供职十余年、有着三千次开刀经历的外科医师，丰富的从艺经验、阳光向上的开朗性格加上崇高无上的医德，让他成为广大患者的福音。泽村精湛的医术很快一起医院内外的关注，而以森山卓（高岛政伸 饰）医生为首的一众“寄生虫”则视其为眼中钉。 白衣天使的明争暗斗，关乎荣誉与私利的对决……

不知曾几何时，突然出现的巨人成为人类文明的掘墓者。他们肆意捕食毫无反抗能力的人类，逼迫他们筑起高墙予以自保。直到某天，超大型巨人打破坚固的壁垒，带给习惯了安逸生活的人类一场血腥残酷的饕餮盛宴。韩吉（石原里美 饰）秘密捕获了一只巨人，她疯狂痴迷地研究巨人的习性，试图找到敌人的弱点，并且从一次意外中得到了立体机动装置的灵感。家庭贫困的萨沙（樱庭奈奈美 饰）拥有绝赞的箭技和超好的胃口，她有幸成为调查队的一员，食物是她最大的动力。莉露（武田梨奈 饰）和富士（渡部秀 饰）拼命磨练格斗技巧，他们希望过上幸福的小日子，只是和平的岁月遥遥无期。 小人物们，在巨人的阴影下奋力求生……

一度内忧外患、濒临崩溃的堂上综合医院，在外科医生相良浩介（泽村一树 饰）到来的第二个年头，无论从业绩还是口碑均取得了令人满意的成绩。更为重要的是，曾经紧张非常的医患关系得以纾解，一度丧失了责任心的医护人员也受到相良的感召，投入到救死扶伤的工作中去。而就在此时，院长（野际阳子 饰）发表辞职声明，同时指名外甥——相良最大的劲敌森山卓（高岛政伸 饰）担任下任院长。这项人事任免在医院内部引起不小的轰动，人人感到一场强力的风暴即将到来。 各种情况的患者接二连三送入堂上医院，相良与团队重逢在救治的第一线，而风头正劲的森山则成为阻挡他的不小的障碍……

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